2006年9月14日，財政部、發展改革委、商務部、海關總署、中國稅務總局聯合發出通知，調整部分商品出口退稅率并增補加工貿易禁止類商品目錄。通知規定，從2006年9月15日起調整部分商品出口退稅率，包括三個部分：首先是取消部分商品的出口退稅，其次是降低部分商品的出口退稅率，第三是提高部分商品出口退稅率。
提高出口退稅率的主要商品是：重大技術裝備、部分IT產品和生物醫藥產品以及部分中國產業政策鼓勵出口的高科技產品等，出口退稅率由13%提高到17%；部分以農產品為原料的加工品，出口退稅率由5%或11%提高到13%。
另外，通知還增補了加工貿易禁止類商品目錄，將此前已經取消出口退稅以及本次取消出口退稅的商品，列入加工貿易禁止類目錄。對列入加工貿易禁止類目錄的商品優良，從2006年9月15日起一律征收優良關稅和優良環節增值稅，禁止類目錄的具體商品名稱及稅號由商務部會同有關部門另行發布。
從三個方面影響機械工業
首先，一大批機械產品的出口退稅率由現行的13%提高到17%，增加4個百分點，有利于降低這些產品的出口成本，有利于機械工業出口產品結構和產業結構的改善。特別是發電設備，預計在“十一五”后期國內電站需求有所減少、有關企業生產任務可能面臨不足的情況下，出口退稅率的提高為擴大出口提供了良好的環境，有關企業要抓住這一機遇擴大出口。
其次，大批鋼材(142個稅號)出口退稅率減少3個百分點和部分有色金屬(85個稅號)出口退稅率分別減少8個、5個和2個百分點，增加了這些原材料的出口成本，將有可能使其中的部分原材料轉入國內市場(如型鋼、角鋼、槽型鋼、冷軋合金鋼板材、熱軋不銹鋼卷板、取向性硅電鋼寬板和窄板、履帶板型鋼均減少3個百分點，銅板和銅管減少8個百分點，鋁板和鋁型材減少2個百分點)。減少這些產品的出口退稅率，會有利于國內市場原材料的競爭，從而降低國內原材料的價格，尤其是銅和銅材出口退稅率由13%降到5%。據預計，銅和銅材在國際市場價格相對穩定的情況下，國內市場價格漲勢將有所抑制，這將有利于機械工業部分相關產品降低生產成本、提高經濟效益。
第三，鉛酸蓄電池(含起動發動機用)出口退稅率從現行的13%降至零，并列入禁止加工貿易出口商品目錄，將對該行業的發展產生重大影響。據海關統計，2005年我國鉛酸蓄電池出口8.09億美元(不包括零件)，其中加工貿易出口1.92億美元，占出口額的23.7%。這次政策調整主要是由于鉛酸蓄電池是屬于高污染產品，將有利于該產品的升級換代，促使有關企業從環保入手尋求出路。
目前，有些企業已開發研制新一代產品---膠體鉛酸蓄電池。據介紹，這種蓄電池容量高、污染少、無泄漏，但這種蓄電池比普通鉛酸蓄電池制造成本要高許多，因此降低成本的任務很重。同時，企業還要重視廢舊蓄電池的回收利用工作，以防止污染環境。新一代符合環保要求的產品出口后，應及時向政府有關部門反映，爭取恢復出口退稅。
另外，國內鉛酸蓄電池市場也要從嚴管理，實行市場準入制度，以逐步提高進入的門檻。
出口退稅調整的兩點建議
首要點建議，進一步調整機械產品的出口退稅率。
這次將一批技術含量高的機械產品出口退稅率恢復到原來的17%的水平，是對2004年出口退稅政策調整的完善和補充。目前，還有許多高技術的機械產品出口退稅率仍偏低，建議繼續調整。這將有利于生產企業降低出口成本，提高經濟效益，調動企業擴大高技術含量產品出口的積極性。
建議將以下機械產品從13%恢復到17%：輸變電設備中的高壓開關(含組合電器)，中、大容量變壓器，鋼材和有色金屬軋機及零件，連鑄機，石油鉆機零件，印刷機械中的膠印機，加氫反應器，工業除塵器，混凝土泵，注塑機，塑料中空成型機，礦物洗選破碎磨粉設備，非數控機床中的鏜銑床、電加工機床、磨床、龍門銑床、大型壓力機，聯合收割機，金屬或硬質合金用模具，塑料或橡膠用模具，靜電感光復印設備，彩色膠卷洗印設備，B型超聲波診斷儀，彩色超聲波診斷儀，自動調節或控制儀器，測量、檢驗儀器，坐標測量儀，飲料及液體食品罐裝設備，全自動水泥灌包機，高精度軸承，機械密封件等。
第二點建議，取消銅和銅材、鋁和鋁材的出口退稅。
銅和銅材、鋁和鋁材是機械工業的重要原材料，近期來國內市場上這兩種材料價格持續飛漲。銅的價格去年底每噸為3.8萬元，到今年5月每噸突破8萬元。電解銅今年1～9月平均價格每噸6.5萬～7萬元之間，較年初的4萬元左右上漲了約70%。鋁的價格去年11月每噸1.7萬元，到今年2月漲到2.2萬元，其后始終高位攀升，上漲幅度達30%。這導致電線電纜、變壓器、通用低壓電器和其他需要銅、鋁的機械產品生產成本激增，嚴重影響我國相關產業的發展。
據海關統計，我國銅和銅材2005年出口量與出口額分別為60.82萬噸、26.23億美元，今年1～8月為58.55萬噸、35.19億美元。鋁和鋁材2005年出口量與出口額分別為203萬噸、43.3億美元，今年1～8月為160.15萬噸、42.69億美元。
與此同時，由于我國需用的這兩種材料國內資源不足，所以大部分依靠優良。銅和銅材2005年優良253.37萬噸，今年1～8月優良134萬噸。鋁和鋁材2005年優良128.45萬噸，今年1～8月優良82.34萬噸。
為此建議，應控制這兩種材料的出口，取消其出口退稅，增加國內市場的貨源供應。在國際市場價格相對穩定或波動不大的情況下，促使國內市場價格漲勢有所抑制，為國內機械工業發展營造一個相對適度的環境。